药检所实验室的建设以科学合理、规模适当、资源共享和不重复建设为原则。选址在交通便利、环境安静、远离污染源的区域，同时确保供水供电稳定。
实验室的规划应充分考虑其功能需求，包括实验室分区、设备布局、通风系统、人流物流通道等。布局应科学合理，确保实验室的高效运行和人员的便捷操作。
功能间包括中心实验室、仪器室、微生物检查室、干燥室、消毒室、试剂存放间、玻璃仪器存放间、毒气室、特殊气体供应室以及留样观察等辅助功能间。各功能间应保持适当的距离，避免交叉污染，同时便于人员、设备及物品的流通。配备空气净化系统、温湿度控制系统及通风系统。特殊功能间严格分开，设置人净和物净设施。
空气净化系统：实验室应配备专业的空气净化系统，确保实验室内的空气质量达到标准要求。
温湿度控制系统：实验室应设置温湿度控制系统，以维持实验室内的温度和湿度在适宜范围内。
通风系统：实验室应具备良好的通风系统，包括新风系统和排风系统。新风应全部来自室外，并经过过滤处理;排风应直接排出室外，避免在室内循环。
无菌室相对正压或负压，配备独立的中心库房，按储存内容不同分为试剂库、常温留样室、阴凉留样室及冷藏室。实验室保持洁净、安全、稳定的环境，配备专业的空气净化系统、温湿度控制系统及通风系统。无菌检查、微生物限度检查与抗生素微生物检定的实验室应严格分开，并设置人净和物净的设施。无菌操作间应根据检验品种的需要，保持对邻室的相对正压或相对负压，并定期检测洁净度。
工程技术设计要求
地面水平工程：药物分析实验室使用的仪器设备均要求水平安装和使用，地面水平工程在实验室工程设计与施工中应列入重点内容。
防尘、防噪音、防震工程：实验室防尘、防噪音、防震三防工程是实验室建设中的设计重点。防止尘埃污染主要是与外界进行有效隔断，对尘埃有PPM级要求的微生物实验室要采用净化空气。
净化与排风工程：实验室的排风系统设计应有效隔断，以确保实验室内环境的安全与舒适。
动物实验室工程：动物实验室设计应遵循独立选址原则，要求与其他实验设施分离建设，所处位置应僻静、卫生无污染。
中心库房工程：为保证检品、留样、试剂、实验室其他工作用品的安全存放，配备独立的中心库房。
植化分析室工程：规划设置为标本室和植化实验室，通过对中药材标本的整理、鉴定、贮藏、维护、交流、展示及对检品提取、分离、纯化来开展中药检定与植物药研发工作。
实验室安全及应急工程：设立急救室，配备医学急救、应急沐浴以及洗眼基本设施;配备备用发电机并有可靠和充足的电力供应和应急照明。
